Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGA7Q13683 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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ITGA7Q13683 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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ITGA7Q13683 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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ITGA7Q13683 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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ITGA7Q13683 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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ITGA7Q13683 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA7Q13683 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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