Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
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