Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRQ13535 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ATRQ13535 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRQ13535 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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