Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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