Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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