Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PRKAA1Q13131 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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