Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms