Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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