Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PTPN13Q12923 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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