Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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