Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXO1Q12778 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXO1Q12778 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXO1Q12778 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXO1Q12778 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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