Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms