Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC15Q0P6D6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms