Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms