Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms