Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms