Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms