Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms