Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms