Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CD164Q04900 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CD164Q04900 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CD164Q04900 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CD164Q04900 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CD164Q04900 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms