Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 RPL6P8-201ENST00000490136 843 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC104116.1-201ENST00000504539 411 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CLEC12B-201ENST00000338896 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC004231.1-201ENST00000418393 815 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PACRG-AS3-201ENST00000419182 1131 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms