Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OC90Q02509 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OC90Q02509 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OC90Q02509 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms