Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms