Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYBPC1Q00872 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms