Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FAM3AP98173 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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