Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3F3AP84243 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms