Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRX1P78414 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX1P78414 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX1P78414 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms