Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCE1P61221 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms