Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2NP61088 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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