Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN8P56748 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms