Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXG1P55316 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXG1P55316 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXG1P55316 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXG1P55316 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXG1P55316 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXG1P55316 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXG1P55316 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXG1P55316 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXG1P55316 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXG1P55316 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXG1P55316 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXG1P55316 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXG1P55316 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXG1P55316 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXG1P55316 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXG1P55316 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms