Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASP9P55211 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP9P55211 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP9P55211 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms