Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms