Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUCLG1P53597 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms