Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS1P48651 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms