Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NEDD4P46934 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4P46934 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms