Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATRXP46100 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms