Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PBX2P40425 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBX2P40425 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms