Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGAEP38570 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms