Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN2P35609 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms