Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms