Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms