Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC12P31275 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms