Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms