Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLD1P28340 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLD1P28340 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms