Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHATP28329 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHATP28329 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHATP28329 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHATP28329 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHATP28329 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHATP28329 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHATP28329 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHATP28329 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHATP28329 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHATP28329 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHATP28329 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms