Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX2P28328 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX2P28328 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms