Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
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