Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYF6P23409 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYF6P23409 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYF6P23409 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYF6P23409 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYF6P23409 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYF6P23409 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYF6P23409 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYF6P23409 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYF6P23409 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYF6P23409 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYF6P23409 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYF6P23409 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYF6P23409 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYF6P23409 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms