Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGS1P23219 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms